黃連性味苦寒，清熱解毒，健骨治瀉。可治發熱煩燥、譫語、惡心嘔吐、腸炎痢疾、吐血衄便血、熱毒瘡瘍、眼結膜炎、扁桃腺炎、口舌生瘡等癥，是治療熱性病的要藥。使用方法用干品5分—2錢水煎服或點眼。亦可配石膏、滑石研成細末治溫疹、化膿性潰瘍。陰虛煩熱、脾虛泄瀉、婦人產生血虛及小兒痘疹等忌用。