衣原體是出名的性傳播致病菌，能引起急性或慢性感染。在男性表現(xiàn)為、附睪和直；女性則表現(xiàn)力、、尿道綜合征以及癥性疾病。
    衣原體的發(fā)病在規(guī)定報(bào)告的地方、在那些經(jīng)常開(kāi)展普查的高危人群中及有可靠實(shí)驗(yàn)室檢查的地方較多。在西方工業(yè)化國(guó)家，這種普查相當(dāng)普遍。衣原體是最常見(jiàn)的可治愈的性傳播疾病。在美國(guó)每年報(bào)告起碼有400萬(wàn)病例，歐洲也起碼有300萬(wàn)病例。亞洲的數(shù)據(jù)不太完整,但也足以證明在男性和女性尿道炎致病菌中,衣原體要比淋球菌更為常見(jiàn)。
    發(fā)病率數(shù)據(jù)還未包括許多無(wú)癥狀性衣原體感染。在西方估計(jì)有25-30%的男性衣原體尿道炎是無(wú)癥狀或亞臨床的，而7O-80%的女性衣原體宮頸炎亦是如此。對(duì)這么大量的匿性傳染貯源必須予以治療并且根治，以杜絕感柒在社區(qū)中的傳播。
    女性中隱匿性宮頸炎可以上行到上生殖道而導(dǎo)致并發(fā)癥。的確，衣原體性?xún)?nèi)膜和輸卵管感染很大部分是
    亞臨床的。隱匿性輸卵管感染據(jù)認(rèn)為是輸卵管性的最因，在北歐和美國(guó)已得到有關(guān)數(shù)據(jù)的證實(shí)。衣原體在輸卵管性不孕癥中的作用，可以從先前感染史中得到證實(shí)。許多研究表明，在有輸卵管疾病的不孕婦女中，血清抗原陽(yáng)性率最著高于輸卵管無(wú)損傷的婦女。
    雖然在輸卵管活檢標(biāo)本中很少分離到衣原體，但衣原體抗原和核酸檢查卻己證實(shí)內(nèi)膜組織中存在衣原體。在這些培養(yǎng)陰性但抗原陽(yáng)性的病例中，輸卵管慢性炎癥不可能是由于先前已經(jīng)根治的感染所遺留的非復(fù)制性抗原所造成的。更有可能的是衣原體以非培養(yǎng)的形態(tài)殘留于組織中，但仍具有活性并且能誘發(fā)免疫病理變化。
    衣原體的殘留己在不同的細(xì)胞培養(yǎng)系中得到證實(shí)。沙眼衣原體有獨(dú)特的生命周期，具有兩種截然不同的形態(tài)和功能：原體(EB)和網(wǎng)狀體(RB)。EB是感染相，攻擊宿主細(xì)胞并進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)。一旦進(jìn)入宿主細(xì)胞后，就寄居在小泡內(nèi)，外由通過(guò)溶酶體小囊防止溶解的包膜包裹。然后，它轉(zhuǎn)化成具有代謝活性的微粒RB，開(kāi)始生產(chǎn)蛋白和核酸，并通過(guò)二分裂復(fù)制。隨著反復(fù)的復(fù)制，核內(nèi)體擴(kuò)展成為顯微鏡下可見(jiàn)的包涵體。在這個(gè)通常48-72小時(shí)的周期末，RB轉(zhuǎn)化為多個(gè)EB，并通過(guò)細(xì)胞溶解而釋放出來(lái)，去感染其它細(xì)胞并重復(fù)一個(gè)周期。